对比2011年《目录》和2005年《目录》可以发现，在农业的产业结构调整方面，鼓励先进技术的开发和应用仍是重点内容。在2005年《目录》鼓励类的基础上，2011年《目录》增加了畜禽标准化规模养殖技术开发与应用，生物育种，种子生产、加工、贮藏及鉴定，农业生物技术开发与应用等条目。